Calcul biliaire d’un prince momifié du XVIe siècle utilisé pour reconstruire l’ancien génome d’ E. coli

Quand vous pensez aux précieux joyaux de la couronne, un calcul biliaire vieux de 400 ans n’est probablement pas ce qui vous vient à l’esprit !

Cependant, une équipe de scientifiques a trouvé quelque chose de très précieux à l’intérieur de boules calcifiées extraites de la vésicule biliaire d’un prince italien du XVIe siècle.

Des restes du premier E. Coli ont été découverts et des chercheurs de l’Université McMaster au Canada les ont utilisés pour reconstruire le premier génome ancien de la bactérie.

Cela peut servir de «point de comparaison» pour nous donner des informations sur la façon dont le superbactérie notoire a évolué au cours des 400 dernières années.

Les résultats, publiés aujourd’hui dans la revue Communications Biology, pourraient permettre aux chercheurs de déterminer à terme quand E. Coli a acquis une résistance aux antibiotiques.

Les restes momifiés de Giovani d’Avalos ont été récupérés de l’abbaye de Saint Domenico Maggiore à Naples en 1983, ainsi que ceux d’autres nobles italiens de la période de la Renaissance.

Le noble napolitain, décédé en 1586 à l’âge de 48 ans, aurait souffert d’une inflammation chronique de la vésicule biliaire due à des calculs biliaires.

L’auteur principal de l’étude, George Long, a déclaré: «Lorsque nous examinions ces restes, il n’y avait aucune preuve indiquant que cet homme avait E. coli.

« Contrairement à une infection comme la variole, il n’y a pas d’indicateurs physiologiques. Personne ne savait ce que c’était.

E. coli, ou Escherichia colipeut infecter les organes qui contribuent à la production et au transport de la bile, y compris la vésicule biliaire.

Il est capable de libérer une enzyme qui peut transformer la bilirubine, une substance chimique produite lors de la dégradation normale de l’hémoglobine, en sels de calcium – la première étape de la formation des calculs pigmentaires.

En plus de contribuer à la formation de calculs biliaires, E. Coli peut provoquer des intoxications alimentaires, des diarrhées, des infections des voies urinaires et des pneumonies.

Elle est connue sous le nom de « commensal », une bactérie qui réside en nous et peut agir comme un pathogène opportuniste infectant son hôte pendant les périodes de stress, de maladie sous-jacente ou d’immunodéficience.

E. Coli est également connu pour sa résistance aux antibiotiques, ce qui lui vaut son titre de « superbactérie ».

Les chercheurs ont dû isoler méticuleusement des fragments de la bactérie cible, qui avaient été dégradés par une contamination environnementale provenant de plusieurs sources.

Ils ont utilisé le matériel récupéré pour reconstruire le premier génome ancien d’E. Coli.

Cependant, l’équipe de recherche a expliqué que son histoire évolutive complète reste un mystère, y compris quand il a acquis une résistance aux antibiotiques.

Le professeur Hendrik Poinar, chef de la recherche, a déclaré: “Une concentration stricte sur les agents pathogènes à l’origine de la pandémie en tant que seul récit de la mortalité de masse dans notre passé passe à côté du lourd fardeau qui découle des commmensals opportunistes entraînés par le stress des vies vécues.”

Le généticien évolutionniste, le professeur Poinar, de l’Université McMaster du Canada, qui a dirigé la recherche, a déclaré: «E. coli moderne se trouve couramment dans les intestins de personnes et d’animaux en bonne santé.

“Alors que la plupart des formes sont inoffensives, certaines souches sont responsables d’épidémies d’intoxication alimentaire et d’infections du sang graves, parfois mortelles.” La bactérie robuste et adaptable est reconnue comme particulièrement résistante aux traitements.

Il a expliqué que le fait d’avoir le génome d’un ancêtre de 400 ans de la bactérie moderne fournit aux chercheurs un “point de comparaison” pour étudier comment il a évolué et s’est adapté depuis lors.

Il a expliqué que l’exploit technologique est particulièrement remarquable car E. coli est à la fois “complexe et omniprésent” – vivant non seulement dans le sol mais aussi dans nos propres microbiomes.

Le professeur Erick Denamur, de l’Université Paris Diderot, a déclaré: “C’était tellement émouvant de pouvoir taper cet ancien E. coli et de découvrir que, bien qu’unique, il appartenait à une lignée phylogénétique caractéristique des commensaux humains qui provoque encore aujourd’hui des calculs biliaires. ‘

Long a ajouté: “Nous avons pu identifier ce qui était un agent pathogène opportuniste, creuser jusqu’aux fonctions du génome et fournir des lignes directrices pour aider les chercheurs qui pourraient explorer d’autres agents pathogènes cachés.”